Esta historia arrancó el 14 de septiembre de 1980 con el banderazo de salida en la pista atlética de la Unidad Deportiva Enrique Fernández Martínez, para el primer maratón organizado en el país.
El guanajuatense Hilario Álvarez se convertía en el primer ganador, al cruzar la meta por delante de los 586 atletas que se dieron cita. El mismo Hilario ganaría de manera consecutiva las primeras tres ediciones del maratón.
Desde el 2002 a la fecha, la supremacía de los corredores kenianos ha marcado el ritmo de la historia.
Simon Sawe lo ganó en dos ocasiones (2002 y 2004), Hillary Kimaiyo dos además del récord vigente, mientras que Nkaya Peter presume dos primeros lugares, de las 15 victorias que han logrado los africanos en la historia del maratón.
Por los guanajuatenses, además de Hilario Álvarez, aparece el leonés Noe Moreno que lo ganó en 1992 y 1998, Andrés Torres en 1985 y 1987, Ignacio Carretero en 1999 y 2001, Daniel Vargas en 2010 y el silaoense Fernando Cervantes en 2019.
En la femenil fue la leonesa Gloria Alonso la que escribió su nombre con letras de oro en 1981 al ganar la primera edición del maratón de la ciudad.
La africana Caroline Kiptoo ha ganado en cinco ocasiones, Elena Reyna en tres, y la leonesa Flora Moreno dos en 1983 y 1993.
